Важным фактором успешной деятельности наукоемких и высокотехнологичных предприятий является его экономическая безопасность. Этим предприятиям для обеспечения экономической безопасности необходимо больше проводить затрат на внедрение инноваций и новых технологий. Активная инновационная деятельность в перспективе позволяет достигать наукоемким и высокотехнологичным предприятиям лучшие результаты, что безусловно повышает их экономическую безопасность. В работе представлен анализ факторов обеспечения экономической безопасности предприятий в региональном разрезе. При этом показаны успехи и недостатки региональных высокотехнологичных предприятий по обеспечению собственной экономической безопасности за счет развития инновационной деятельности.