Аннотированный список бриофлоры заказника «Лисинский» насчитывает один вид антоцеротовых, 46 видов печеночников, 138 видов и одну разновидность мхов. Бриофлора имеет бореальный характер и в целом сходна с другими южнотаежными, в меньшей степени – с подтаежными бриофлорами Северо-Запада Европейской России как по набору видов, так и по пропорциям экологических спектров. В ее состав входят 8 видов, внесенных в Красную книгу Ленинградской области, и 26 редких видов, не имеющих статуса охраняемых