Организационная структура виртуальной организации, как правило, динамична и изменяется в зависимости от набора задач, решаемых компанией. В статье исследуется задача определения оптимальной структуры виртуального предприятия методом выделения кластеров на множестве элементарных трудовых операций. Атрибуты, характеризующие эти операции зачастую измеряются по шкале категорий, то есть не могут быть выражены в числовом виде, поэтому для кластеризации предлагается использовать масштабируемые алгоритмы, основанные на оптимизации глобальной функции, к наиболее эффективным из подобных относится алгоритм CLOPE. Описана методика применения алгоритма для оптимизации распределения задач между подразделениями.