В статье рассматривается вопрос соотношения административно-территориального деления субъекта РФ и организации местного самоуправления. Особое внимание уделяется селу как территориальной единице и его месту в правовом регулировании административно-территориального устройства. На примере Республики Марий Эл отмечаются некоторые проблемы при категорировании субъектом РФ населенных пунктов, в частности, делается акцент на необходимости совершенствования понятий административно-территориальных единиц и критериев отнесения населенных пунктов к тем или иным видам. Автором предлагается модернизировать административно-территориальное устройство Республики Марий Эл в целях обеспечения сбалансированного развития территорий и недопущения смешения территориальных основ местного самоуправления и административно-территориального устройства. Кроме того, высказываются опасения по поводу возможного перехода на одноуровневую модель территориальной организации местного самоуправления и его влияния на сельские населенные пункты.